Yoluxucu qastroenterit koronavirusu

Yoluxucu qastroenterit koronavirusu və ya Transmissiyalı qastroenterit virusu (TGEV) Koronaviruslar ailəsinin, Alfakoronavirus sinifinin, Alfakoronavirus 1 növünə aid virusların alt növüdür.^[2] TGEV tək telli RNT genomu və vintli simmetriya ilə əhatə olunmuş viruslardır. Koronavirusların genom ölçüsü təxminən 28,6 kilobazadək dəyişir.^[3]

TGEV-nin ümumi quruluşuna töhfə verən zülallar sünbül (S), zərf (E), membran (M) və nukleokapsid (N) daxildir. Alfakoronavirus 1 növünə aid olan digər koronaviruslara Pişik koronavirusu, Pişik yoluxucu peritonit virusu və İt koronavirusu daxildir.

Koronaviruslar TGEV ailəsinə aiddir. Sinifüstü Alfakoronavirus sinifi isə Alfakoronavirus 1-dir. Bu müsbət tək telli RNT genomu olan bükülmüş bir virusdur. TGEV-də fosfoprotein (N), ayrılmaz membran zülalı (E1) və böyük glikoprotein (E2) olan üç əsas struktur zülal var. N zülalı genom RNT-ni kapsullaşdırır, S proteini isə viral proqnozlar əmələ gətirir.

Təxminən 8000 nukleotidin 3 seqmenti subgenomik RNTləri kodlayır. Genomun qalan hissəsi viral replikazı kodlayır. 5 'dən 3'ə qədər olan üç ən böyük gen ardıcıllığı E2 ilə E1'dən N'ə qədər olur. Strukturla əlaqəli olmayan təxminən yeddi digər açıq ox çərçivəsi var. Ox çərçivəsi genlər arasında çox az üst-üstə düşür və sıx bir yerdə yerləşir. Bir genom ölçüsü və bir neçə subgenom ölçülü RNT-lərin transkripsiyası üçün mənfi bir ip sintez olunur.

E2 zülalı, virusun səthindən ləçək şəklində 20 nm uzunluğunda bir proyeksiya meydana gətirir. E2 proteininin sitoplazmasına daxil olmasına kömək edərək patogenezə yerləşir. Golgidə zülalın qlikozilasiyasından sonra protein yeni virusa daxil olur. E2 zülalının daxilində bir neçə funksional sahə var. C-terminalında 20 qalıq hidrofob seqmenti lipid membranındakı zülalı lövbərləyir. Zülalın qalan hissəsi iki hissəyə bölünür, virusun içərisindəki hidrofilik uzanır və yağ asilləşdirmə yerləri olan bir sisteinlə uzanır. E1 zülalı əsasən lipid zərfinə daxil olur və buna görə virus quruluşunda vacib rol oynayır. E1 zülalı, IFN kodlayan genlərin induksiyasına səbəb olan lenfosit membranı ilə qarşılıqlı əlaqəyə girir.

S zülalı hüceyrə reseptoru olan porcin aminopeptidase N (pAPN) ilə qarşılıqlı təsirə girirək, girişinə kömək edir. Eyni hüceyrə reseptoru da İnsan Koronavirusu üçün keçərlidir. S sünbül zülalındakı bir domen pAPN tərəfindən tanınır və icazə verilməyən hüceyrələrə PAPN-nin transfeksiyası baş verir və onları TGEV ilə yoluxdurur.

TGEV morfologiyası əsasən elektron mikroskopiya üsulları ilə müəyyən edilib. Morfologiyası, səthi proqnoza və bir zərfə sahib olduğu üçün miksovirus və onkogen virusa bənzəyir. Virusların ölçüsü 100 ilə 150 nm arasında dəyişən dairəvi forması var. Proyeksiyalar əsasən çox dar bir sap ilə bağlanmış ləçək şəklində olur. Proyeksiyalar virusdan çox asanlıqla ayrılır və yalnız müəyyən ərazilərdə olur.

TGEV əsasən donuzlara yoluxur. 1 həftədən kiçik pigletlərdə ölüm nisbəti 100% -ə yaxındır. TGEV'nin patologiyası digər koronaviruslara bənzəyir. Virus özü tərəfindən yoluxduqdan sonra, kiçik bağırsağın hüceyrə astarında çoxalır, bu da udma hüceyrələrinin itirilməsinə səbəb olur və bu da villi qısalmasına səbəb olur. Bundan sonra yoluxmuş donuzlar qida həzm etmək qabiliyyətini azaldaraq və susuzluqdan ölürlər.^[4]

Yoluxucu qastroenterit koronavirusu ekspressiya vektoru kimi hazırlanıb. Vektor transkripsiyanı tənzimləyən ardıcıllıqla (TRS) yaşıl flüoresan zülal ilə idarə olunan qeyri-mənfi 3a və 3b ORF ilə əvəz olunub. Yaranan quruluş enteropatogenlaşır, lakin böyüməsi azalır. Bu əvəzlənən virusla hüceyrələrin infeksiyası heteroloji zülala qarşı xüsusi bir laktogen immun cavabı alır. Bu vektorun tətbiqi peyvənd və ya hətta gen terapiyasının inkişafında rol oynayır. TGEV genomunun mühəndisliyi üçün motiv odur ki, koronavirusların böyük genomları var, buna görə xarici genlərin daxil edilməsi üçün yer var. Koronaviruslar tənəffüs aparatını da yoluxdurur və onlardan antigenləri həmin bölgəyə yönəltmək və bəzi immun reaksiyalar yaratmaq üçün istifadə edilə bilər.

• Laude H, Rasschaert D, Delmas B, Godet M, Gelfi J, Charley B. "Molecular biology of transmissible gastroenteritis virus". Veterinary Microbiology. 23 (1–4). June 1990: 147–54. doi:10.1016/0378-1135(90)90144-K. PMID 2169670.
• Sola I, Alonso S, Zúñiga S, Balasch M, Plana-Durán J, Enjuanes L. "Engineering the Transmissible Gastroenteritis Virus Genome as an Expression Vector Inducing Lactogenic Immunity". Journal of Virology. 77 (7). April 2003: 4357–69. doi:10.1128/JVI.77.7.4357-4369.2003. PMC 150661. PMID 12634392.
• Tajima M. "Morphology of transmissible gastroenteritis virus of pigs". Archives of Virology. 29 (1). March 1970: 105–8. doi:10.1007/BF01253886. PMID 4195092.